史诗般的航行发现珊瑚礁中惊人的微生物多样性
世界上最大的太平洋珊瑚调查进行了100,000公里,从249个地点收集了58,000个样本,包括印度尼西亚、日本和巴布亚新几内亚。

图片来源:Pete West/Tara海洋基金会
这是有史以来最大规模的太平洋珊瑚调查发现,世界珊瑚礁的遗传多样性可能比研究人员之前认为的要多。
该评估是基于报告Tara Pacific远征结果的一系列研究 ,Tara号船只进行了为期两年的研究航行,调查了珊瑚礁的遗传、化学和微生物多样性。研究人员估计,在过去70年中,全球一半以上的珊瑚覆盖范围已经消失,相关物种多样性的60%也消失了。海洋科学家、微生物学家和船员于2016年5月28日从法国洛里昂港启航后一起航行了100,000公里。从249个地点收集了58,000个样本,包括印度尼西亚、日本和巴布亚新几内亚。
在《自然通讯》上发表的一项研究中,巴黎索邦大学的海洋微生物学家皮埃尔·加兰 (Pierre Galand) 和他的同事从大约5,000个样本中对一个常用于鉴定和分类微生物的基因进行了测序。它被称为16S核糖体DNA标记基因。该团队发现了542,399个称为扩增子序列变异(ASV)的DNA序列,这是衡量细菌遗传变异的一种方法。
Galand说他很惊讶地在一个地方发现了50万个序列,有44,000个ASV与印度洋珊瑚有关。
作者说来自太平洋的数据占地球所有细菌和古细菌群落多样性已知估计值的五分之一。
研究人员估计全球珊瑚礁的多样性约为280万个ASV。巴黎PSL大学的海洋生态学家、该联盟的负责人Serge Planes说地球上所有微生物群落的已知价值也可能比现有估计值高得多。
科学家们说,他们希望利用最新的结果来揭示多样性与珊瑚礁功能和健康的联系,包括气候变化和污染的影响。
同样发表在《自然通讯》上的另一项研究探索了一种通常与珊瑚相关的细菌的遗传和分子构成。这项研究目的在了解细菌可能提供的好处,例如帮助珊瑚获取维生素和氨基酸。Corentin Hochart也是索邦大学的博士生,他研究了三种内生单胞菌科(通常与珊瑚相关的细菌家族),以更好地了解细菌在珊瑚健康和功能中的作用。研究人员对三个珊瑚属样本中的细菌遗传物质进行了测序,这三个珊瑚属是Pocillopora(花椰菜珊瑚)、滨珊瑚( Porites)(石珊瑚)和Millepora(火珊瑚),这些样来自太平洋的99个珊瑚礁中。他们研究发现每个珊瑚属都与不同的内生单胞菌科物种有关,每种细菌都会产生不同种类的维生素和氨基酸,它们可能对珊瑚健康和免疫力具有重要作用。
目前该团队仍在分析探险的数据。预计明年将发表另一批论文,深入探讨是什么推动了珊瑚生物学和生理学的变化,以及这些变化如何影响珊瑚礁生态系统。
来源:nature